Мы об этом не знаем (ну если без спойлеров, я честно говоря так далеко оригинал не читал). По идее, если Котел не хотел конца света, он бы не помогал Джеку. КС произошел бы, но значительно позже, или его удалось избежать. Тут скорее, Котел хочет как-то использовать КС (например, построить мир Джека где кейпы будут богами, но с собой в виде главного божества и т.п.)

P.S. Если есть базы и лаборатории значит они относительно легко перемещаются между мирами и легко могут сбежать сами и захватить всех им нужных (кейпом и не кейпом) до КС.