"Когда перечитывал, зацепило замечание, что Шмелю не понравилось, что змея-хоркрукс убита. Не пойму, почему ему нужна была живая Нагини."

Наверное, потому, что он хотел, чтобы змею грохнул Гаррик. Также Дамбик мог решить, что кто-то левый вмешается в его планы.