Ковровые бомбардировки, напалм, "грязная" бомба (есть ли у магов заклинания от радиоактивности)? На крайний случай -- ядрен-батон.

Если протего при работе тянет силы из мага, то пулеметную очередь мало кто удержит.

Интересный вопрос -- работает ли конфундус и магглоотталкивающие чары на автоматизированные турели и тому подобные фокусы.

Тепловые датчики, лазерные, те же "датчики объема" у самой обычной сигнализации -- скорее всего будут срабатывать даже на "невидимых" непрошенных гостей и точно -- на аппарацию.

В конце концов, не обязательно кинетическое оружие. Инфразвук, микроволновое направленное излучение, инфракрасный излучатель (чтобы кожа слезала от ожогов через десятую долю секунды облучения), лазер по глазам и не только (тут все зависит от мощности)...

Даже обычная ударная волна -- не факт что будет останавливаться протего. Ветер же такой щит не блокирует. А привести организм в состояние, несовместимое с жизнью -- запросто.

У магов есть аппарация и империо. Круто, но но тотальную войну может не хватить.